Πολλά προβλήματα στο στόμα μας είναι αποτέλεσμα διαφορετικών αιτιολογικών παραγόντων πέρα από το μικροβιακό. Η λάθος θέση των δοντιών στο στόμα (συνωστισμός, στροφή, απόκλιση), η έλλειψη δοντιών, το έντονο βούρτσισμα και η χρήση σκληρής οδοντόβουρτσας, το σφίξιμο ή τρίξιμο των δοντιών και οι λάθος επαφές ανάμεσα στα δόντια αποτελούν προβλήματα που είτε επηρεάζουν την περιοδοντική θεραπεία και την τροποποιούν, είτε απαιτούν συγκεκριμένη θεραπευτική προσέγγιση. Τα προβλήματα αυτά πρέπει πάντα να επισημαίνονται και να συζητούνται καθώς μπορεί να προκαλέσουν μη επιδιωκόμενο θεραπευτικό αποτέλεσμα, όταν δεν λαμβάνονται υπόψη.